百炼成仙系统中共有12种丹药可供炼制，配方分为基础、进阶和高阶三个层级。基础丹药包括回灵丹（灵草×2+清水×1）、固元丹（血参×2+灵芝×1）、破障丹（天心草×3）三种，对应恢复灵力、提升体质、突破瓶颈三个需求。进阶丹药需要在基础药材上叠加稀有材料，高阶丹药则要求特定境界后才能解锁配方。
炼制流程需要先在百炼炉投入药材，等待12小时自动完成。投料顺序会影响成品品质：主药材放第一位能提升20%成功率，辅料按从稀有到普通的顺序依次投入可额外增加15%极品概率。同一炉最多放5份材料批量炼制，但失败时会全部报废，建议新手单次只放2-3份。炼制过程中可消耗灵石加速，每小时需10灵石，但加速不影响成品质量，纯粹缩短等待时间。
配方选择与收益对比
前期重点炼制回灵丹和固元丹。回灵丹单次恢复500点灵力，材料产出稳定，适合日常刷本消耗；固元丹提升的体质加成在50级前收益最高，每颗永久增加8点体质上限。破障丹虽然能直接提升5%突破成功率，但天心草需要击杀40级以上的妖兽才掉落，前期材料不够优先攒着给大境界突破用。进阶丹药里，凝神丹（增加10%悟性持续2小时）配方需要血参×3+星辰花×1+月华露×1，星辰花只在每周三、周六的秘境中产出，炼一炉需攒三周材料，但对参悟功法的加成比基础丹高4倍，有材料时优先炼这个。
高阶丹药的配方在元婴期后通过宗门任务解锁，其中化劫丹能降低天劫伤害30%，配方是血参×5+雷击木×2+九转仙芝×1。雷击木需要在雷雨天气去雷鸣峰采集，九转仙芝是宗门贡献商店兑换品，单颗需要2000贡献。这个配方成本高但渡劫期必备，提前半个月开始攒材料。还魂丹能复活一次保留80%修为，配方未公开需要通过特殊剧情触发，目前已知的触发条件是完成隐藏任务”生死轮回”。
炼制时炉温控制直接决定品质。普通品质丹药药效只有标准值的70%，极品能达到150%。炉温通过投料间隔调节，每次投料后等待5秒再投下一份可稳定在适温区间，连续快速投料会导致炉温过高、药材烧焦。已经出现焦糊提示后立即停止投料、等待30秒降温还能挽救，强行继续投料必定全炉报废。